Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms