Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NR2F1P10589 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms