Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEFLP07196 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEFLP07196 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms