Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN9O95484 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN9O95484 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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