Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms