Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms