Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP9BO43861 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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