Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALUO43852 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALUO43852 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALUO43852 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALUO43852 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CALUO43852 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms