Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms