Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms