Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR3AO14802 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR3AO14802 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms