Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2F3O00716 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E2F3O00716 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms