Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms