Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
USP9YO00507 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USP9YO00507 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USP9YO00507 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms