Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEDD8-MDP1E9PL57 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms