Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTMR11A4FU01 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms