Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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BIVM-ERCC5R4GMW8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
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