Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PLXND1Q9Y4D7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PLXND1Q9Y4D7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLXND1Q9Y4D7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLXND1Q9Y4D7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLXND1Q9Y4D7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXND1Q9Y4D7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms