Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms