Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXL4Q9UKA2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXL4Q9UKA2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms