Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms