Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms