Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms