Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNAJB9Q9UBS3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms