Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms