Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D2Q9NY47 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms