Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYLDQ9NQC7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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