Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMMDC1Q9NPL8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms