Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2TQ9NPD8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms