Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-5Q9HDB9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms