Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCSER1Q9C0I3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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