Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP44Q9C0F1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms