Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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