Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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COL25A1Q9BXS0 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL25A1Q9BXS0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL25A1Q9BXS0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL25A1Q9BXS0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL25A1Q9BXS0 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL25A1Q9BXS0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms