Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms