Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MCMBPQ9BTE3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms