Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMKLR1Q99788 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms