Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LCORQ96JN0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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LCORQ96JN0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LCORQ96JN0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LCORQ96JN0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LCORQ96JN0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LCORQ96JN0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LCORQ96JN0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LCORQ96JN0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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