Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms