Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms