Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTV1Q96GA3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms