Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms