Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms