Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms