Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms