Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDAQ92838 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EDAQ92838 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EDAQ92838 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EDAQ92838 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EDAQ92838 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms