Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC9Q92623 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms