Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BRSK1Q8TDC3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRSK1Q8TDC3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms