Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf43Q8TAL5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf43Q8TAL5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf43Q8TAL5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms