Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms